El Projecte Educatiu d'Institució. conegut pels pares, els professors i els alumnes, es resum en els següents punts:

• L'educació ha de ser entesa com a estímul i desenvolupament de les aptituds personals per afrontar amb criteri les diverses circumstàncies de la vida.
• L'educació ha de ser personalitzada, humanista, oberta a les realitats transcendents, científica i participativa.
• El treball ben fet és el mitjà ordinari per assolir el perfeccionament humà i espiritual i per contribuir al bé comú.
• Tots han d'aprendre a conviure amb respecte, cooperació i tolerància.
• Institució té un caràcter estrictament civil. Per voluntat fundacional, totes les activitats docents i educatives es realitzen d'acord amb la doctr ina catòlica i respectant plenament la llibertat de cada consciència.
• Des dels inicis, els pares de família promotors dels col·legis van desitjar que l'atenció espiritual que s'hi ofereix s'encomanés a sacerdots de la Prelatura de l'Opus Dei. Aquests sacerdots són personalment responsables de la seva comesa i realitzen la seva tasca depenent de la Direcció de cada centre.
• Es procura que els alumnes siguin, com a mínim trilingües, és a dir, que acabin els seus estudis amb un ple coneixement del català, del castellà i de l'anglès.
• En els col·legis d'Institució, que són de nens o de nenes excepte a l'educació infantil, els primers educadors són els pares. Institució compta amb una actitud decidida de col·laboració per part de les famílies.
• Una peça clau per coordinar l'acció educativa és la preceptuació. Consisteix en l'atenció personalitzada, feta per un professor o professora a les necessitats educatives i formatives de cada alumne i de cada família.
• Institució fomenta la participació activa per part dels pares en la vida i les activitats de cada centre educatiu.
• La formació permanent dels professionals de l'educació –necessària per a la qualitat de l'ensenyament– és un dels objectius fundacionals d'Institució.
• El treball en equip, el contrast d'experiències i la participació activa dels professors en la investigació dels problemes educatius són propis de l'estil dels centres d'Institució.

Institució té una estructura descentralitzada, de forma que la iniciativa i els recursos es troben als col·legis.

Un Consell vetlla per l'ideari d'Institució i una Comissió Executiva coordina les tasques comunes a totes les escoles, com ara política de personal, equip docent, política lingüística, nous projectes, organització, orientació personal, escolar i professional dels alumnes, formació de pares i mares, i del professorat, etc

.Les grans línies dels temes assenyalats les marca la Comissió Executiva, però l'estudi i l'aplicació a cada col·legi depenen del mateix Consell de Direcció i del seu Consell Escolar.

La col·legialitat al govern, en tots els seus nivells, és un tret específic d'Institució i de cada col·legi: totes les decisions es prenen per consens entre les persones que constitueixen aquell òrgan de govern (Consell, Comissió Executiva, Consell de Direcció i Consell Escolar dels col·legis).